MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus geothermalis DSM 11300 plasmid pDGEO01

Total Repeats: 12597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008010	GGCA	2	8	462	469	25 %	0 %	50 %	25 %	94971945
2	NC_008010	CG	3	6	482	487	0 %	0 %	50 %	50 %	94971945
3	NC_008010	GGCT	2	8	562	569	0 %	25 %	50 %	25 %	94971945
4	NC_008010	CGATCT	2	12	654	665	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	94971945
5	NC_008010	TCCC	2	8	669	676	0 %	25 %	0 %	75 %	94971945
6	NC_008010	CCTGGC	2	12	684	695	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	94971945
7	NC_008010	GAT	2	6	705	710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94971945
8	NC_008010	ACG	2	6	770	775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94971945
9	NC_008010	TTGA	2	8	781	788	25 %	50 %	25 %	0 %	94971945
10	NC_008010	GCCC	2	8	791	798	0 %	0 %	25 %	75 %	94971945
11	NC_008010	GC	3	6	824	829	0 %	0 %	50 %	50 %	94971945
12	NC_008010	TGG	2	6	845	850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94971945
13	NC_008010	GAG	2	6	910	915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94971945
14	NC_008010	GCC	3	9	974	982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94971945
15	NC_008010	CGC	2	6	1025	1030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94971945
16	NC_008010	CCG	2	6	1079	1084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94971945
17	NC_008010	GCGG	2	8	1158	1165	0 %	0 %	75 %	25 %	94971945
18	NC_008010	GCA	2	6	1189	1194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94971945
19	NC_008010	CGC	2	6	1215	1220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94971944
20	NC_008010	GCT	2	6	1235	1240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971944
21	NC_008010	CG	3	6	1245	1250	0 %	0 %	50 %	50 %	94971944
22	NC_008010	CCG	2	6	1267	1272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94971944
23	NC_008010	CCG	2	6	1283	1288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94971944
24	NC_008010	GAGC	2	8	1298	1305	25 %	0 %	50 %	25 %	94971944
25	NC_008010	CGG	2	6	1316	1321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94971944
26	NC_008010	G	6	6	1384	1389	0 %	0 %	100 %	0 %	94971944
27	NC_008010	TGC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971944
28	NC_008010	GCT	2	6	1400	1405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971944
29	NC_008010	CGG	2	6	1444	1449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94971944
30	NC_008010	GCC	2	6	1476	1481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94971944
31	NC_008010	CGA	2	6	1520	1525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94971944
32	NC_008010	TGG	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94971944
33	NC_008010	GCT	2	6	1607	1612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971944
34	NC_008010	GAG	2	6	1638	1643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94971944
35	NC_008010	GAT	2	6	1655	1660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94971944
36	NC_008010	CCGA	2	8	1677	1684	25 %	0 %	25 %	50 %	94971944
37	NC_008010	CTG	2	6	1719	1724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971944
38	NC_008010	GCC	2	6	1778	1783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94971944
39	NC_008010	GGCCT	2	10	1812	1821	0 %	20 %	40 %	40 %	94971944
40	NC_008010	GGC	2	6	1829	1834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94971944
41	NC_008010	GTG	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94971944
42	NC_008010	GCC	2	6	1842	1847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94971944
43	NC_008010	CCG	2	6	1852	1857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94971944
44	NC_008010	GAA	2	6	1878	1883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94971944
45	NC_008010	GGC	2	6	1890	1895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94971944
46	NC_008010	GCA	2	6	1904	1909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94971944
47	NC_008010	GA	3	6	1917	1922	50 %	0 %	50 %	0 %	94971944
48	NC_008010	GGC	2	6	1925	1930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94971944
49	NC_008010	GCA	3	9	2030	2038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94971944
50	NC_008010	CG	3	6	2157	2162	0 %	0 %	50 %	50 %	94971943
51	NC_008010	GCG	2	6	2206	2211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94971943
52	NC_008010	AGG	2	6	2374	2379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94971943
53	NC_008010	TCC	2	6	2390	2395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94971943
54	NC_008010	GTA	2	6	2401	2406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94971943
55	NC_008010	GTTCA	2	10	2665	2674	20 %	40 %	20 %	20 %	94971942
56	NC_008010	TGC	2	6	2705	2710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971942
57	NC_008010	CAC	2	6	2712	2717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94971942
58	NC_008010	CGC	2	6	2852	2857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94971942
59	NC_008010	GGT	2	6	2872	2877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94971942
60	NC_008010	GAA	2	6	2893	2898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94971942
61	NC_008010	CTG	2	6	2931	2936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971942
62	NC_008010	TGG	3	9	2963	2971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94971942
63	NC_008010	GCG	3	9	2972	2980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94971942
64	NC_008010	TGG	2	6	2993	2998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94971942
65	NC_008010	CAC	2	6	3048	3053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94971942
66	NC_008010	GGGCGT	2	12	3075	3086	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	94971942
67	NC_008010	AAG	2	6	3112	3117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94971942
68	NC_008010	CGC	2	6	3137	3142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94971942
69	NC_008010	CTT	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94971942
70	NC_008010	GGGC	2	8	3201	3208	0 %	0 %	75 %	25 %	94971942
71	NC_008010	GCT	2	6	3231	3236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971942
72	NC_008010	CTT	2	6	3249	3254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94971942
73	NC_008010	GGA	2	6	3309	3314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94971942
74	NC_008010	GCG	2	6	3415	3420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94971942
75	NC_008010	GGCGGT	2	12	3465	3476	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	94971942
76	NC_008010	GGC	2	6	3536	3541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94971942
77	NC_008010	CTG	3	9	3553	3561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971942
78	NC_008010	GGGC	2	8	3666	3673	0 %	0 %	75 %	25 %	94971942
79	NC_008010	GCT	2	6	3687	3692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971942
80	NC_008010	CCG	2	6	3695	3700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94971942
81	NC_008010	CTG	2	6	3739	3744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971942
82	NC_008010	CGC	2	6	3745	3750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94971942
83	NC_008010	ACC	2	6	3779	3784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94971942
84	NC_008010	CTGC	2	8	3818	3825	0 %	25 %	25 %	50 %	94971942
85	NC_008010	TC	3	6	3848	3853	0 %	50 %	0 %	50 %	94971941
86	NC_008010	GCT	2	6	3875	3880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971941
87	NC_008010	GGC	2	6	3887	3892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94971941
88	NC_008010	GCT	2	6	3941	3946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971941
89	NC_008010	CCGG	2	8	3988	3995	0 %	0 %	50 %	50 %	94971941
90	NC_008010	AGCG	2	8	4000	4007	25 %	0 %	50 %	25 %	94971941
91	NC_008010	GAT	2	6	4010	4015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94971941
92	NC_008010	CCT	2	6	4037	4042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94971941
93	NC_008010	CGA	2	6	4150	4155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94971940
94	NC_008010	GGTCG	2	10	4209	4218	0 %	20 %	60 %	20 %	94971940
95	NC_008010	CGAC	2	8	4219	4226	25 %	0 %	25 %	50 %	94971940
96	NC_008010	ACC	2	6	4257	4262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94971940
97	NC_008010	CAC	2	6	4264	4269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94971940
98	NC_008010	CG	5	10	4279	4288	0 %	0 %	50 %	50 %	94971940
99	NC_008010	AGG	2	6	4335	4340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94971940
100	NC_008010	CGC	2	6	4518	4523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94971940
101	NC_008010	TGA	2	6	4602	4607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94971940
102	NC_008010	AC	3	6	4624	4629	50 %	0 %	0 %	50 %	94971940
103	NC_008010	GAT	2	6	4636	4641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94971940
104	NC_008010	ACG	3	9	4827	4835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94971940
105	NC_008010	AGTC	2	8	4880	4887	25 %	25 %	25 %	25 %	94971940
106	NC_008010	GGC	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94971940
107	NC_008010	TGC	2	6	4986	4991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971939
108	NC_008010	CGA	2	6	5001	5006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94971939
109	NC_008010	GTGC	2	8	5008	5015	0 %	25 %	50 %	25 %	94971939
110	NC_008010	CTG	2	6	5113	5118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971939
111	NC_008010	GGCA	2	8	5123	5130	25 %	0 %	50 %	25 %	94971939
112	NC_008010	TGC	2	6	5306	5311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971939
113	NC_008010	GGC	2	6	5326	5331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94971939
114	NC_008010	CGA	2	6	5336	5341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94971939
115	NC_008010	GTG	2	6	5419	5424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94971939
116	NC_008010	TTCA	2	8	5461	5468	25 %	50 %	0 %	25 %	94971939
117	NC_008010	CCTCGA	2	12	5469	5480	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	94971939
118	NC_008010	CGGA	2	8	5489	5496	25 %	0 %	50 %	25 %	94971939
119	NC_008010	CTG	2	6	5497	5502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971939
120	NC_008010	TGA	2	6	5511	5516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94971939
121	NC_008010	CTG	2	6	5542	5547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971939
122	NC_008010	GGC	2	6	5551	5556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94971939
123	NC_008010	GC	3	6	5555	5560	0 %	0 %	50 %	50 %	94971939
124	NC_008010	CG	3	6	5602	5607	0 %	0 %	50 %	50 %	94971939
125	NC_008010	GA	3	6	5613	5618	50 %	0 %	50 %	0 %	94971939
126	NC_008010	GAGCGC	2	12	5783	5794	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	94971939
127	NC_008010	GGA	2	6	5808	5813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94971939
128	NC_008010	ACCT	2	8	5815	5822	25 %	25 %	0 %	50 %	94971939
129	NC_008010	CAACC	2	10	5975	5984	40 %	0 %	0 %	60 %	94971939
130	NC_008010	GCT	2	6	6006	6011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971939
131	NC_008010	TGC	2	6	6065	6070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971939
132	NC_008010	GCT	2	6	6090	6095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971939
133	NC_008010	GATG	2	8	6126	6133	25 %	25 %	50 %	0 %	94971939
134	NC_008010	GGT	2	6	6214	6219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94971938
135	NC_008010	TCC	2	6	6273	6278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94971938
136	NC_008010	TGC	2	6	6291	6296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971938
137	NC_008010	GACC	2	8	6343	6350	25 %	0 %	25 %	50 %	94971938
138	NC_008010	CCG	2	6	6417	6422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94971938
139	NC_008010	GCT	2	6	6445	6450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971938
140	NC_008010	TGGC	2	8	6452	6459	0 %	25 %	50 %	25 %	94971938
141	NC_008010	CTG	2	6	6491	6496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971938
142	NC_008010	CG	3	6	6566	6571	0 %	0 %	50 %	50 %	94971938
143	NC_008010	CGG	2	6	6585	6590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94971938
144	NC_008010	CTG	2	6	6623	6628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971938
145	NC_008010	GGCTG	2	10	6658	6667	0 %	20 %	60 %	20 %	94971938
146	NC_008010	CCGGC	2	10	6696	6705	0 %	0 %	40 %	60 %	94971938
147	NC_008010	G	6	6	6757	6762	0 %	0 %	100 %	0 %	94971938
148	NC_008010	GGC	2	6	6799	6804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94971938
149	NC_008010	TGGG	2	8	6806	6813	0 %	25 %	75 %	0 %	94971938
150	NC_008010	CGG	2	6	6853	6858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94971938
151	NC_008010	GAT	2	6	6871	6876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94971938
152	NC_008010	GCT	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971938
153	NC_008010	G	6	6	6910	6915	0 %	0 %	100 %	0 %	94971938
154	NC_008010	GCT	2	6	6931	6936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971938
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158	NC_008010	CGT	2	6	7025	7030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971937
159	NC_008010	TGC	2	6	7117	7122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971937
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161	NC_008010	GGC	2	6	7234	7239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94971937
162	NC_008010	GC	3	6	7281	7286	0 %	0 %	50 %	50 %	94971937
163	NC_008010	GCC	2	6	7308	7313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94971937
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168	NC_008010	CT	3	6	7465	7470	0 %	50 %	0 %	50 %	94971937
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171	NC_008010	CGA	2	6	7649	7654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94971937
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253	NC_008010	GCA	2	6	16585	16590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94971935
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255	NC_008010	GC	3	6	16809	16814	0 %	0 %	50 %	50 %	94971935
256	NC_008010	A	6	6	16827	16832	100 %	0 %	0 %	0 %	94971935
257	NC_008010	GCG	2	6	16833	16838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94971935
258	NC_008010	GCGA	2	8	16895	16902	25 %	0 %	50 %	25 %	94971935
259	NC_008010	AGC	2	6	16974	16979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94971935
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261	NC_008010	CCG	2	6	17034	17039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94971935
262	NC_008010	CAA	2	6	17047	17052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94971935
263	NC_008010	TGGG	2	8	17093	17100	0 %	25 %	75 %	0 %	94971935
264	NC_008010	GAC	2	6	17110	17115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94971935
265	NC_008010	TGC	2	6	17136	17141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971935
266	NC_008010	CG	3	6	17170	17175	0 %	0 %	50 %	50 %	94971935
267	NC_008010	GTG	2	6	17210	17215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94971935
268	NC_008010	CTG	2	6	17249	17254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971935
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271	NC_008010	ATG	2	6	17318	17323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94971935
272	NC_008010	CTG	3	9	17342	17350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971935
273	NC_008010	GCG	2	6	17354	17359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94971935
274	NC_008010	CTG	2	6	17366	17371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971935
275	NC_008010	CGGG	2	8	17406	17413	0 %	0 %	75 %	25 %	94971935
276	NC_008010	C	6	6	17433	17438	0 %	0 %	0 %	100 %	94971935
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279	NC_008010	TCA	2	6	17538	17543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94971935
280	NC_008010	TGC	2	6	17550	17555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971935
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288	NC_008010	GCA	2	6	17813	17818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94971934
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290	NC_008010	GGC	2	6	18021	18026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94971934
291	NC_008010	GCGTTC	2	12	18030	18041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94971934
292	NC_008010	CCG	2	6	18077	18082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94971934
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299	NC_008010	CAG	2	6	18267	18272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94971934
300	NC_008010	CGA	2	6	18281	18286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94971934
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